دوره‌های بلندمدت مقطع کارشناسی دانشگاه مجازی دارای مجوز از وزارت علوم جمهوری اسلامی ایران هستند. این دوره‌ها به روال تمامی دوره‌های دانشگاهی حداقل در 8 ترم تحصیلی (و در مدت حداقل 4 سال) ارائه می‌شوند. (دوره‌های کارشناسی، حوزوی نیستند.)
محتوای دوره‌های کارشناسی دانشگاه، علوم انسانی و اسلامی است؛ و پس از اتمام موفقیت‌آمیز کل واحدهای تحصیلی (135 واحد) به دانش‌آموختگان مدرک موردتأیید وزارت علوم جمهوری اسلامی ایران اعطا می‌گردد.
دوره‌های بلندمدت مقطع کارشناسی‌ارشد دانشگاه مجازی دارای مجوز از وزارت علوم جمهوری اسلامی ایران هستند. این دوره‌ها به روال تمامی دوره‌های دانشگاهی حداقل در 4 ترم تحصیلی (و در مدت حداقل 2 سال) ارائه می‌شوند. (دوره‌های کارشناسی، حوزوی نیستند.)
محتوای دوره‌های کارشناسی‌ارشد دانشگاه، علوم انسانی و اسلامی است؛ و پس از اتمام موفقیت‌آمیز کل واحدهای تحصیلی (32 واحد) به دانش‌آموختگان مدرک موردتأیید وزارت علوم جمهوری اسلامی ایران اعطا می‌گردد.
دوره‌های کوتاه‌مدت دوره‌هایی با موضوعات علوم اسلامی و انسانی هستند؛ که علاقه‌مندان پس از ثبت‌نام در سامانه پذیرش دانشگاه، می‌توانند از محتوای آن‌ها استفاده نمایند.
پس از اتمام ثبت‌نام، کدکاربری و رمزعبور جهت دسترسی به دوره‌ها از طریق ایمیل برای شما ارسال خواهد شد.
دوره آموزش زبان فارسی دانشگاه مجازی ویژه اتباع غیرایرانی و علاقه‌مندان به زبان و ادبیات فارسی است؛ و از سطح مقدماتی تا پیشرفته (طی 14 ماه) و به شیوه آموزش زبان فارسی آسفا ارائه می‌شود. در پایان به زبان‌آموختگان مدرک معتبر دانشگاه مجازی المصطفی اعطا می‌گردد؛ که علاقه‌مندان برای اخذ پذیرش از کلیه دانشگاه‌های ایران می‌توانند از این مدرک استفاده نمایند.
این دوره دارای شهریه است؛ و برای یادگیری در آن به هیچ زبان واسطی نیاز نیست.
دوره آموزش زبان انگلیسی دانشگاه مجازی، ویژه فارسی‌زبانان بوده و از شیوه آموزشی Top Notch تبعیت می‌کند.
این دوره دارای شهریه ترمی است؛ و پس از گذراندن موفق 8 ترم (برای سطح مقدماتی تا سطح متوسط) به زبان‌آموختگان مدرک معتبر دانشگاه مجازی المصطفی اعطا خواهد گردید.
